A SP2 valóban eltér az eddig megszokott szervízcsomagtól, több (ám többségében azért pozitív) vonatkozásban is. A tesztelői alaposság ellenére a kiadás után mégis jelentősen megszaporodtak az ún. KB (Knowledge Base = a Microsoft Tudásbázis oldala, éppen a napokban újult meg) cikkek mellett az egyéb internetes csoportoktól, levelezőlistákról származó jelzések is, amelyek mind-mind a telepítéssel, a hardver eszközökkel, az alkalmazásokkal kapcsolatos problémákról számoltak be az SP2 apropóján. Ezek közül illetve egyéb személyes tapasztalatokból mazsolázunk ebben a cikkben.
Virusirtók
A legtöbb szervizcsomag telepítés vagy operációs rendszer frissítés alkalmából a rendszerben lévő vírusirtót (illetve legalább a rezidensen működő "pajzsot", az online védelmet) logikus lépés kikapcsolni. Nincs ez másképp az SP2-nél sem, azzal a különbséggel, hogy esetleg nemcsak a telepítés hanem később az operációs rendszer működése is meghiúsulhat egy nem vagy nem teljesen kompatibilis virusirtó alkalmazás miatt. Több termékkel is gond van, az ismertek közül pl. a McAfee, a SonicWALL és a Command AntiVirus szofverekkel biztosan, de számíthatunk problémákra egyéb, főképp régebbi kiadású virusirtó szoftvereknél is. Instabil működést, rendszerösszeomlást és észrevehető lassulást egyaránt okozhatnak. Egyik fő probléma, hogy a virusirtók működésének természetes velejárója az, hogy az operációs rendszer gyári szervizeihez hasonlóan a háttérben, szolgáltatásként futtatnak egy vagy több komponenst is, amelyet viszont immár a megváltozott biztonsági körülmények miatt (az SP2 megköveteli, hogy ezek a szervizek megfelelően visszafogott jogosultsággal fussanak) nem tud indítani vagy kezelni a Windows XP SP2. Ezért ha történetesen hibát nem is, működéskiesést, vagy a virusadatbázisok automatikus frissítésének elmaradását mindenképpen okozhatják az SP2-re fel nem készített alkalmazások. A javallat az, hogy mielőtt telepítjük az új szervizcsomagot, mindenképpen keressük fel a virusirtónk weboldalát és nézzünk utána az SP2 kompatibilis javításnak vagy a program új verziójának és alkalmazzuk ezeket még a telepítés előtt.
A Security Center és a virusirtók
Az SP2 telepítése után aktivizálja magát egy új komponens, a Security Center (Biztonsági Központ), melynek feladata három részből áll. Egyrészt figyeli az új tűzfal állapotát és figyelmeztet abban az esetben ha nincs bekapcsolva a tűzfal, másrészt detektálja az Automatic Updates (Automatikus frissítések) állapotát, és szintén jelzi, ha nem aktív ez a szolgáltatás. A harmadik feladata pedig az, hogy megpróbálja ellenőrizni azt, hogy létezik-e a rendszerünkben telepített virusirtó és annak virusadatbázisa aktuális-e. Bármely komponens hiányára utaló figyelmezetés a tálcán jelenik meg, és szándékosan körülményesen kikapcsolható. Az első kettő Microsoft termék, tehát a detektálásával nem lehet gond, azonban virusirtót rengeteg cég készít, így nem könnyű feladat a minden ilyen alkalmazásra egyaránt kiterjedő érzékelés. A detektálási folyamat egy ún. WMI (Windows Management Instrumentation) nevű keretrendszeren keresztül működik, amely egy szabványhalmazra épül, azonban elképzelhető, hogy virusirtó cég nem gondoskodott arról, hogy bekerüljön a termékéről némi információ ebbe az "adatbázisba", ezért a Security Center számára nem is léteznek. A megoldáshoz ki kell kapcsolnunk a figyelést, vagy megvárhatjuk a virusirtó cég frissítését. A fentiek kifejezetten a munkacsoportos modellre vonatkoznak, mert egy tartományban a Security Center alapértelmezés szerint, központilag tiltva van.
CD/DVD emulátorok
Ha a programjaink között szerepelnek a fenti célt megvalósító alkalmazások (pl. az Alcohol CD/DVD Software vagy a Daemon Tools), akkor szinte biztosak lehetünk abban, hogy az SP2 telepítése elakad valami ehhez hasonló hibaüzenettel: "Setup cannot copy the file Atapi.sys". Ennek oka, az, hogy ezek az alkamazások "fogják" lemez meghajtó szoftverét, amely ezért nem engedélyezi a telepítőnek az állományok biztonsági mentését a frissítés alatt. Ebben az esetben a megoldás az, hogy távolítsuk el ezeket a szoftvereket, frissítsünk SP2-re, majd a sikeres művelet után, újra feltelepíthetjük ezeket az alkalmazásokat és nyugodtan használhatjuk tovább.